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中國成人2型糖尿病遺傳風險變異評估

摘要:2016年4月6日Diabetologia在線發(fā)表的一項大規(guī)模人群隊列研究,評估了中國成人2型糖尿病的遺傳風險變異,結(jié)果表明,基于大規(guī)模人群研究獲得的風險變異效應值,低于之前病例對照研究的結(jié)果。

2016年4月6日Diabetologia在線發(fā)表的一項大規(guī)模人群隊列研究,評估了中國成人2型糖尿病遺傳風險變異,結(jié)果表明,基于大規(guī)模人群研究獲得的風險變異效應值,低于之前病例對照研究的結(jié)果。

生活方式、營養(yǎng)過剩以及肥胖均是2型糖尿病發(fā)病的主要影響因素,但同時,遺傳因素也扮演著非常重要的角色。全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)和大規(guī)?;蚍中脱芯恳寻l(fā)現(xiàn)了90余個2型糖尿病易感基因位點,絕大多數(shù)常見的變異易感基因位點在不同種族中均存在,但并非所有在歐洲人群中發(fā)現(xiàn)的易感基因位點都能在東亞人群中獲得驗證。此外,病例對照研究中通過GWAS獲得的位點,其影響常由于疾病譜偏倚和/或Winner’sCurse而被夸大。為避免這些偏倚,需要大規(guī)模以人群為基礎(chǔ)的研究,來對GWAS發(fā)現(xiàn)的變異單體和聯(lián)合影響進行評估。

注:疾病譜偏倚指過高估計測試結(jié)果;Winner’sCurse指高估新發(fā)現(xiàn)的變異效果。

本研究納入中國慢性病前瞻性研究(ChinakadoorieBiobank,CKB)中93,131例參與者的遺傳數(shù)據(jù),其中糖尿病患者7,109例。并對56個經(jīng)GWAS確定的2型糖尿病相關(guān)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)進行分析。

分析流程

CKB研究中基因位點單體變異的易感性與GWAS的發(fā)現(xiàn)一致

56個變異位點中,48個位點與GWAS最初報道的變異效應在方向上一致(二項分布檢驗,P=2.3×10-8)。在東亞人群與中國漢族人群中GWAS發(fā)現(xiàn)的全部8個風險位點均顯示影響方向一致,經(jīng)多重檢驗校正后,MAEA和GLIS3位點與2型糖尿病有顯著相關(guān)性。

東亞人群與歐洲人群效應值的一致性

CKB研究中等位基因優(yōu)勢比(ORs)與歐洲人群(主要來自病例對照研究)結(jié)果具有較高關(guān)聯(lián)性(r=0.18,P=2.1×10-36),但在中國人群中的效應值有明顯低于歐洲人群的趨勢,優(yōu)勢比對數(shù)logeOR平均減少19%(95%CI6,32;P=4.8×10-3)。與亞洲人群(采用亞洲2型糖尿病遺傳流行病學聯(lián)盟AGEN-T2D研究,主要來自病例對照隊列)相比,CKB研究中的效應值亦有輕度降低,下降22%(P=3.4×10?3)。這些結(jié)果反映出大規(guī)模以人群為基礎(chǔ)的研究可校正病例對照研究存在的疾病譜偏倚和Winner’sCurse問題。

中國人群與歐洲人群效應值評估

GRSs與2型糖尿病風險預測

通過ROC曲線對52個SNPs進行分析,以評估對CKB研究中糖尿病的預測能力,結(jié)果顯示,相比未加權(quán)的遺傳風險評分(GRSs),基于之前薈萃分析的加權(quán)GRSs識別能力顯著改善,尤其是不同種族的預測準確性更高(AUC0.590[0.583,0.597],P=3.6×10-20,不同種族vs.未加權(quán))。

注:GRSs用于評價遺傳易感因素在風險預測模型中的效果,考慮SNP對疾病的不同效應,以SNP效應作為權(quán)重,計算所有納入SNP的OR值權(quán)重。

CKB研究中GRS-Ts預測糖尿病的ROC曲線

較瘦成人受遺傳影響更大

分層分析顯示,GRS-T和GRS-BC與BMI、腰圍WC、腰臀比WHR、體脂率PBF存在顯著交互作用(P交互<1×10?4),GRS評分每增加1單位,對較瘦人群的影響更大。相反,GRS-IR則與BMI、腰圍WC、腰臀比WHR或體脂率PBF無顯著交互作用(P交互≥0.11)。

注:GRS-T為總體遺傳風險評分,GRS-BC為β細胞功能相關(guān)遺傳風險評分,GRS-IR為胰島素抵抗相關(guān)遺傳風險評分。

不同肥胖指標分層與GRS的相關(guān)性

本研究評估了中國人群2型糖尿病遺傳風險變異的效應值,并與之前的病例對照研究進行對比,提示較大規(guī)模以人群為基礎(chǔ)的研究,很大程度上可以避免高估的問題。

CKB是中國醫(yī)學科學院與英國牛津大學聯(lián)合開展的慢性病國際合作項目,旨在通過建立基于血液的基礎(chǔ)健康數(shù)據(jù)庫,從遺傳、環(huán)境和生活方式等多個環(huán)節(jié)深入研究危害中國人群健康的各類重大慢性?。ㄈ缒X卒中、冠心病、癌癥、糖尿病、高血壓等)的致病因素、發(fā)病機理及流行規(guī)律和趨勢,為有效地制定慢性病預防和控制對策,開發(fā)新的治療和干預手段,提供科學依據(jù)。項目在中國10個?。▍^(qū))開展,共涉及512,891例中國成人,持續(xù)時間15至20年。

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