近幾年來(lái),隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)概念的推進(jìn),基因檢測(cè)技術(shù)當(dāng)下備受人們的推崇,它就像給人體做了一個(gè)詳細(xì)的說(shuō)明書(shū)。然而,由于做基因檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)室繁多,關(guān)于基因突變的重新分類并沒(méi)有一套完整的系統(tǒng)或規(guī)范,不同實(shí)驗(yàn)室對(duì)突變的術(shù)語(yǔ)命名體系也不同,基因檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)部還存在不少問(wèn)題。
日前,美國(guó)《紐約時(shí)報(bào)》對(duì)該話題進(jìn)行了深入的研究和報(bào)道。
報(bào)道稱,基因檢測(cè)出來(lái)的結(jié)果看似是一錘定音——基因存在突變或不存在,該突變會(huì)增加某疾病風(fēng)險(xiǎn),或不增加。但事實(shí)上,這些發(fā)現(xiàn)并非看上去的那樣簡(jiǎn)單直接,結(jié)果也可能會(huì)對(duì)病患們?cè)斐蓢?yán)重影響。
雖然一個(gè)人的基因組不會(huì)怎么變化,但研究中和疾病相關(guān)的某個(gè)DNA片段很多都處于不斷變化之中。基因?qū)W家和基因測(cè)試實(shí)驗(yàn)室不斷地收到新信息,使得其可以對(duì)基因突變進(jìn)行重新評(píng)估和分類。
因此,今天看起來(lái)可能為良性的突變,明天有可能就會(huì)變得十分兇險(xiǎn),反之亦然。但目前還沒(méi)有一種好的方式令醫(yī)生和病患獲得更新后的消息。
這造成的結(jié)果便是:你幾年前測(cè)試過(guò)的基因,如今可能已完全變成另外一個(gè)結(jié)果。當(dāng)然,這樣的問(wèn)題只影響少數(shù)病人,其中大多數(shù)有不尋常的基因突變。更為常見(jiàn)的導(dǎo)致疾病的突變——比如那些會(huì)預(yù)測(cè)你可能患乳腺癌或結(jié)腸癌的突變——已經(jīng)被深入地研究過(guò),因此它們的含義通常不需要再質(zhì)疑。
實(shí)驗(yàn)報(bào)告只是一次性結(jié)果
據(jù)美國(guó)《紐約時(shí)報(bào)》報(bào)道,在最近的一項(xiàng)研究中,一家診斷性公司Myriad遺傳學(xué)公司的研究人員,對(duì)過(guò)去2006年至2016年間曾做過(guò)基因測(cè)試的145萬(wàn)病人的數(shù)據(jù)進(jìn)行了重新評(píng)估,以查看這些原始報(bào)告中的結(jié)果是否屬實(shí)。
實(shí)驗(yàn)室對(duì)其中的6萬(wàn)名患者發(fā)布了新的基因測(cè)試報(bào)告,這意味著舊版結(jié)果已經(jīng)完全被新數(shù)據(jù)所取代。但攜帶有被重新分類的突變基因的許多病患,仍被蒙在鼓里。美國(guó)貝勒醫(yī)學(xué)院的臨床遺傳專家莎倫·普隆醫(yī)生說(shuō)道,“這個(gè)系統(tǒng)完全是一片混亂。”她說(shuō),現(xiàn)在根本沒(méi)有一套成系統(tǒng)的方式可以告知病人和醫(yī)生,以前被認(rèn)為無(wú)害的突變?nèi)缃褚呀?jīng)顯示出有健康危害,或者以前人們認(rèn)為危險(xiǎn)的突變現(xiàn)在證實(shí)其實(shí)是良性的。
“部分實(shí)驗(yàn)室報(bào)告的只是一次性的結(jié)果。”得克薩斯州西南醫(yī)學(xué)中心癌癥遺傳學(xué)項(xiàng)目主任羅斯醫(yī)生(TheodoraRoss)說(shuō)道,“他們不會(huì)再去重新評(píng)估10年前的測(cè)試結(jié)果解釋方式,除非醫(yī)生們要求。”但醫(yī)生們幾乎不會(huì)過(guò)問(wèn),她補(bǔ)充說(shuō)。
正常情況下,醫(yī)生會(huì)要求有嚴(yán)重家族病史的人進(jìn)行基因測(cè)試,比如心臟病、中風(fēng)或癌癥。病人血液或唾液樣本會(huì)被送到實(shí)驗(yàn)室,其DNA會(huì)被掃描是否存在異常突變。
實(shí)驗(yàn)室會(huì)將這些突變與此前科學(xué)研究中所顯示的可能導(dǎo)致疾病的突變進(jìn)行對(duì)比。有些病人會(huì)被告知,他們的突變沒(méi)有多大意義。有些病人則會(huì)被告知,某個(gè)可疑基因存在“釋義原因不明的變種”,這意味著沒(méi)人知道該怎么辦。
還有部分病人出現(xiàn)看似危險(xiǎn)的基因突變,意味著有很高風(fēng)險(xiǎn)可能患癌、心臟病或其他疾病。對(duì)這些病人來(lái)說(shuō),這樣的結(jié)果意味著需要定期檢測(cè),會(huì)改變生活的一系列決定,包括是否生育等。
混亂的體系,各實(shí)驗(yàn)室間難以調(diào)和
聯(lián)邦政府提供資金支持建立的數(shù)據(jù)庫(kù)ClinVar,可以讓實(shí)驗(yàn)室之間分享基因突變數(shù)據(jù),以及他們認(rèn)為這些突變的意義。但部分公司,比如Myriad,雖然儲(chǔ)存了關(guān)于基因突變的海量數(shù)據(jù),卻并沒(méi)有向ClinVar分享。
而即便是DNA變異的術(shù)語(yǔ),也沒(méi)有被廣泛統(tǒng)一和分享。不同實(shí)驗(yàn)室有著不同的命名體系。比如,ClinVar用這種方式表達(dá)其中一個(gè)DNA的變異:NM_004004.5(GJB2):c.101T>C(p.Met34Thr),而另外一家實(shí)驗(yàn)室則是這樣表達(dá):c.101T>C,p.Met34Thr,GJB2。麻省綜合醫(yī)院博德研究所的臨床遺傳學(xué)家HeidiRehm說(shuō)道,病人自己搜索信息時(shí)“會(huì)不知道在ClinVar里輸入何種關(guān)鍵詞”。
除了術(shù)語(yǔ)問(wèn)題外,羅斯醫(yī)生稱,實(shí)驗(yàn)室之間也存在不可調(diào)和的問(wèn)題。比如,當(dāng)一家大型實(shí)驗(yàn)室“報(bào)告了一種基因突變的重新分類方式,而其他實(shí)驗(yàn)室卻還沒(méi)有,你的家庭成員們?cè)诓煌瑢?shí)驗(yàn)室做了檢測(cè),那么對(duì)同一個(gè)病人的數(shù)據(jù)就會(huì)出現(xiàn)不同的解讀。”羅斯說(shuō)道,“我們?cè)撊绾谓鉀Q?又該如何告知病人呢?”
像Myriad這樣的實(shí)驗(yàn)室,往往會(huì)在突變基因信息被重新分類后通知醫(yī)生。但即便這樣,醫(yī)生也可能不會(huì)聯(lián)系和通知其病人。“我?guī)啄陜?nèi)換了幾個(gè)工作地點(diǎn),而且有些病人已經(jīng)搬走了,”普隆醫(yī)生說(shuō),“比如有些病人已經(jīng)不在休斯頓住了,但我卻收到了他們更新后的醫(yī)院報(bào)告,我也不知道這些病人現(xiàn)在住在哪里。”
部分遺傳學(xué)家稱,需要得知更新后結(jié)果的病人往往是基因突變十分罕見(jiàn)的患者。他們不得不每年聯(lián)系醫(yī)生,詢問(wèn)該突變的基因是否重新分類過(guò),以及意味著什么。
突變信息的重新分類,讓他有更多打算
突變信息的重新分類,并非總是好消息。
達(dá)拉斯兒童醫(yī)療中心高級(jí)診斷實(shí)驗(yàn)室臨床主任詹森·帕克博士稱,他曾告訴過(guò)一些患有嚴(yán)重癲癇兒童的父母,原本被認(rèn)為是致病原因的基因突變其實(shí)是一種良性變化。
重新分類可能并不會(huì)改變治療,因?yàn)榧幢阏业搅吮徽J(rèn)為是導(dǎo)致嚴(yán)重癲癇的突變,往往也沒(méi)有具體的治療方式。但父母?jìng)冋J(rèn)為,知道病因總歸比不知道好。“對(duì)這些家庭來(lái)說(shuō),這可能是很大的一個(gè)社會(huì)問(wèn)題。”帕克博士說(shuō),“人們?yōu)槟硞€(gè)特定基因而聚到一起,形成支援小組。但現(xiàn)在他們不再屬于那個(gè)群體。”
但對(duì)居住在得克薩斯州的61歲消防員瑞克·蓋瑞森這樣的人來(lái)說(shuō),突變的重新分類可謂是一根救命稻草。
幾年前,他因?yàn)?a name='InnerLinkKeyWord' href='//www.coldnoir.com/ebhpd/' target='_blank'>鼻子上長(zhǎng)了一個(gè)疣而去看病,但一家病理實(shí)驗(yàn)室在檢查該組織后注意到,他體內(nèi)和林奇綜合征(Lynchsyndrome)相關(guān)的蛋白質(zhì)出現(xiàn)異常變化,這種情況會(huì)導(dǎo)致多種癌癥的發(fā)生率陡增。他后來(lái)去羅斯博士及其遺傳學(xué)團(tuán)隊(duì)那看病,后者將其血液樣本送去做林奇基因突變檢查。結(jié)果是:蓋瑞森的基因存在“釋義原因不明的變種”,而他的診斷也令人困惑:“類似林奇綜合征。”這意味著他得的有可能是這種病,也有可能不是。
醫(yī)生建議稱,他應(yīng)當(dāng)每年都做結(jié)腸鏡檢查、內(nèi)窺鏡檢查以及全身皮膚檢查。但因?yàn)樗倪@種突變并非確定與林奇綜合征有關(guān),因此他的家人——他有5個(gè)孩子,都不用去做檢測(cè)以查看自己是否遺傳該疾病。
然而今年6月,實(shí)驗(yàn)室再次聯(lián)系羅斯醫(yī)生,告知蓋瑞森的這種突變不再被劃分為“釋義原因不明的變異”,對(duì)其他病人的研究證實(shí),該突變的確和林奇綜合征有關(guān)。一切都變了,他的孩子及直系親屬也必須做基因檢測(cè),他該被定期監(jiān)測(cè)各種癌癥跡象。他原本計(jì)劃明年退休,但計(jì)劃必須變了,因?yàn)樗麚?dān)心自己若罹患得林奇綜合征,健康保險(xiǎn)成本太高。他會(huì)繼續(xù)做好這份有保險(xiǎn)的消防工作,等到65歲再退休,屆時(shí)可拿到美國(guó)國(guó)家老年人醫(yī)療保險(xiǎn)。
“我或許最終還是會(huì)因?yàn)榘┌Y而死。”蓋瑞森說(shuō),“但因?yàn)檫@些檢測(cè),我可能還能多活幾年。”
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