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面對腫瘤高度異質(zhì)性,通用型癌癥疫苗可行嗎?

摘要:為了分析腫瘤的遺傳多樣性和評估通用型癌癥疫苗的可行性,研究者分析了超過63,000個(gè)腫瘤的基因組譜,它表明每個(gè)腫瘤通常包含一組獨(dú)特的突變。

  由于腫瘤巨大的遺傳多樣性,開發(fā)癌癥疫苗往往是一個(gè)令人望而生畏的課題。為了調(diào)查通用型癌癥疫苗的可行性,羅氏制藥的研究團(tuán)隊(duì)分析了63,000多個(gè)腫瘤的基因組譜,這項(xiàng)研究于2月24日在線發(fā)表在《GenomeMedicine》期刊上。日前,這篇文章的第一作者、FoundationMedicine的研究員RyanHartmaier在其博客里對他們的發(fā)現(xiàn)進(jìn)行了詳細(xì)的解讀。

  從根本上說,癌癥是由基因突變驅(qū)動(dòng)的基因疾病。確定特定癌癥的基因組譜對尋找最有效的治療方法是非常有效的。最近的研究進(jìn)展表明,我們或可使用基因組信息來調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)以對抗癌癥。

  我們的免疫系統(tǒng)能夠非常有效地識別和清除外來的病原體,如細(xì)菌和病毒。這種能力源于其將外源病原體蛋白片段區(qū)分為“異己”的能力。這些“異己”物質(zhì)就是我們所謂的抗原。免疫系統(tǒng)能夠調(diào)動(dòng)各種攻擊措施和防御能力來對付特定的病原體。通常情況下,我們可以使用疫苗來幫助免疫系統(tǒng)產(chǎn)生更強(qiáng)烈的反應(yīng)。

  與之相似的是,我們現(xiàn)在知道腫瘤內(nèi)的突變可以被免疫系統(tǒng)識別。由于它們僅在癌細(xì)胞中被發(fā)現(xiàn),因此被稱為新抗原(neoantigens)。就像疫苗對傳統(tǒng)病原體(如脊髓灰質(zhì)炎和流感)有效一樣,科學(xué)家們希望針對這些新抗原的疫苗能給癌癥患者帶來更多治療的益處。

  但是由于多種原因,設(shè)計(jì)和開發(fā)癌癥疫苗往往令人望而生畏。癌癥測序項(xiàng)目如癌癥基因組圖譜計(jì)劃(TCGA)表明,腫瘤間具有巨大的遺傳多樣性。對于癌癥疫苗開發(fā),這意味著每個(gè)患者可能需要針對其腫瘤定制疫苗。這限制了這種方法的實(shí)用性,因?yàn)樗蟮募夹g(shù)太高,難以規(guī)?;?,并且對于主流來說,這樣的疫苗過于昂貴。

  為了分析腫瘤的遺傳多樣性和評估通用型癌癥疫苗的可行性,研究者分析了超過63,000個(gè)腫瘤的基因組譜,它表明每個(gè)腫瘤通常包含一組獨(dú)特的突變。

  在這種廣泛多樣性的背景下,研究人員挑選出10種新抗原突變,并使更多的腫瘤(約25%)至少包含其中一個(gè)新抗原突變。這意味著,如果可以針對這10個(gè)突變(apoly-neo-epitopevaccine,多新表位疫苗)開發(fā)癌癥疫苗,那么多達(dá)25%的癌癥患者就可能又有了一種可行的治療選擇。

  但我們知道,并不是所有的突變都能被免疫系統(tǒng)識別。因此,研究者應(yīng)用最先進(jìn)的算法,預(yù)測哪些突變可以被免疫系統(tǒng)識別。在最佳方案的分析中,研究表明通用型癌癥疫苗的方法是可行的,但只有小于1%的癌癥患者群體能受益。

  這種分析提供了寶貴的數(shù)據(jù)來幫助指導(dǎo)癌癥疫苗的開發(fā)工作,雖然仍具有某些局限性,但它提供了強(qiáng)有力的證據(jù),表明癌癥疫苗和其他靶向免疫療法可能需要依賴于個(gè)體化的方法,來使絕大多數(shù)癌癥患者受益。

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