IL2RA-RBM17基因區(qū)域單核苷酸多態(tài)性與中國(guó)蒙古族白癜風(fēng)關(guān)聯(lián)研究
白癜風(fēng)是一種色素脫失性皮膚病,近年遺傳關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),一大批白癜風(fēng)相關(guān)的易感基因中IL2RA-RBM17基因在歐洲及中國(guó)漢族人群的研究中均有報(bào)道。烏日娜等選擇位于IL2RA-RBM17基因區(qū)域的9個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP),用連接酶鏈反應(yīng)(LDR)對(duì)其進(jìn)行基因分型,探討IL2RA-RBM17基因區(qū)域多態(tài)性與蒙古族白癜風(fēng)的相關(guān)性。
方法
收集白癜風(fēng)患者425例,健康對(duì)照503例。用AxyPrep(AP-MX-BL-GDNA-25)基因組DNA抽提試劑盒抽提基因組DNA。選擇位于IL2RA-RBM17基因區(qū)域的9個(gè)單核苷酸多態(tài)性(rs706779、rs3134883、rs7090530、rs12251307、rs4750005、rs3920615、rs4747887、rs4750012、rs7099083),用連接酶鏈反應(yīng)進(jìn)行基因分型。比較白癜風(fēng)組及健康對(duì)照組等位基因頻率及基因型頻率,對(duì)5個(gè)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的SNP間進(jìn)行連鎖不平衡檢驗(yàn),并分析每個(gè)單倍型頻率在白癜風(fēng)組和健康對(duì)照組中的分布。
結(jié)果
5個(gè)SNP(rs4750005、rs3920615、rs4747887、rs4750012、rs7099083)的等位基因頻率與健康對(duì)照組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。5個(gè)SNP在顯性遺傳模式下,白癜風(fēng)組中的基因型頻率均顯著低于健康對(duì)照組(P<0.0056)。5個(gè)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的SNP間存在中等至強(qiáng)的連鎖不平衡(D′=0.424~1,r2=0.137~0.985)。用5個(gè)具有相關(guān)性的SNP構(gòu)建單倍型,分析每個(gè)單倍型頻率的分布,發(fā)現(xiàn)1個(gè)單倍型(H2:CGCTA)在白癜風(fēng)組頻率明顯低于健康對(duì)照組,并達(dá)到Bonferroni校正水平(P=0.0016,OR=0.674)。
結(jié)論
IL2RA-RBM17區(qū)域基因多態(tài)性與蒙古族白癜風(fēng)具有相關(guān)性。