有效治療的目標(biāo)是：1、抑制病毒復(fù)制與去除病毒；2、降低癥狀；3、降低炎癥，改善肝功能；4、預(yù)防進(jìn)展為肝硬化與肝細(xì)胞癌；5、提高患者的生存率。當(dāng)前有許多治療慢性乙型肝炎的方法，包括抗病毒藥、免疫調(diào)節(jié)、細(xì)胞因子、抗纖維化、反義寡核苷酸、核酶等。治療有效的定義為，用非PCR技術(shù)檢測(cè)，HBVDNA從血中持久去除，HBeAg陰轉(zhuǎn)、出現(xiàn)抗HBe，ALT值降到正常。當(dāng)感染由復(fù)制期轉(zhuǎn)為整合期時(shí)，通常的結(jié)局是緩解而非治好。

　　干擾素：近來(lái)一項(xiàng)15個(gè)研究的薈萃分析，評(píng)價(jià)了干擾素的治療效果。和沒(méi)治療的對(duì)照組相比，HBsAg陰轉(zhuǎn)率高6%，HBeAg陰轉(zhuǎn)率高21%。HBVDNA陰轉(zhuǎn)率為20%（檢測(cè)閾為1.5～30.0pg/毫升或者50～100萬(wàn)拷貝/毫升）。如果用PCR檢測(cè)，則HBVDNA陰轉(zhuǎn)率將降低。干擾素每天5MU或者10MU每星期3次或者隔日1回是比較好的治療方案。治療有效的預(yù)測(cè)因子是治療前病毒負(fù)荷量低（HBVDNA80%。

　　如延長(zhǎng)拉米夫定治療時(shí)間（>6個(gè)月），有15%～30%的患者HBVYMDD位點(diǎn)出現(xiàn)突變，這造成拉米夫定治療效果下降。對(duì)拉米夫定有效的最好預(yù)測(cè)因子是基線ALT水平高于標(biāo)準(zhǔn)值上限兩倍，而ALT正常病人的治療效果并不比對(duì)照組好。HBVDNA水平不是HBeAg陰轉(zhuǎn)的預(yù)測(cè)因子，治療20星期內(nèi)患者HBVDNA降到1萬(wàn)拷貝/毫升以下者，有效的可能較大。

　　最好劑量為100毫克/d，盡管較大劑量（300毫克/d）可以使HBVDNA下降更快，然而治療3～6個(gè)月后，HBVDNA去除率與HBeAg陰轉(zhuǎn)率相似。一項(xiàng)亞洲的延長(zhǎng)拉米夫定的療程至3年，可以使HBeAg陰轉(zhuǎn)率升至65%。

　　聯(lián)合治療：在近期的一些研究中，干擾素（10MU）每星期3回，共16星期，加拉米夫定每天100毫克，24星期，有效率達(dá)29%；與之相比，單用一種藥的有效率為18%～19%，但是差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)明顯性。