本病的臨床表現(xiàn)依患者的感染方式、年齡、免疫狀態(tài)，以及合并癥不同而各異。
1.先天性感染 受感染的胎兒除流產(chǎn)、死產(chǎn)外，活嬰中約有5%表現(xiàn)為典型全身CID，即多系統(tǒng)、多臟器受累。另有5%表現(xiàn)為非典型的臨床表現(xiàn)，其余90%均呈亞臨床型。新生兒CID的特征是單核-巨噬細胞系統(tǒng)和中樞神經(jīng)系統(tǒng)受侵犯，如小于胎齡兒，小頭畸形、黃疸、肝脾腫大、皮膚瘀斑、腦積水、腦組織鈣化等。據(jù)Boppana等(1992)106例的分析，本病的主要體征及癥狀為紫癜(76%)、黃疸(67%)，肝脾腫大(60%)、小頭畸形(53%)、體重過輕(50%)、早產(chǎn)(34%)以及脈絡膜視網(wǎng)膜炎、腦積水、腦組織鈣化和低鈣驚厥等，嚴重者多在生后數(shù)天或數(shù)周內死亡;幸存者90%留有后遺癥，如生長遲緩、智力障礙、運動障礙、癲癇、視力減退(視神經(jīng)萎縮)、聽力障礙(神經(jīng)性耳聾)等。
2.圍生期感染 主要通過分娩時的產(chǎn)道感染或經(jīng)宮頸逆行感染及產(chǎn)后喂乳感染等，出生時多無感染癥狀，2～4個月后發(fā)病，多為亞臨床型，以呼吸道和消化道系統(tǒng)癥狀為主，如刺激樣咳嗽(呈百日咳樣)、氣促、發(fā)紺、間質性肺炎表現(xiàn)，黃疸、肝脾腫大、血小板減少性紫癜。本病的病死率可達30%，肺炎合并呼吸衰竭為主要的直接死因。有研究發(fā)現(xiàn)孕早期HCMV原發(fā)感染，對胎兒神經(jīng)系統(tǒng)的損害較孕中期和孕晚期再發(fā)性感染及繼發(fā)性感染者重。
本病的診斷標準(試行，1994年10月，武漢)包括臨床與實驗室兩個方面的依據(jù)：
1.臨床診斷依據(jù) 能證實宿主體內有HCMV侵入，無論有無癥狀或病變均稱為CMV感染。
(1)根據(jù)獲得感染的方式分類：
①先天性感染(congenital infection)：由HCMV感染的母親所生育的子女，于出生14天內(含14天)證實有HCMV感染，為宮內感染所致。
②圍生期感染 (perinatal infection)：由HCMV感染的母親所生育的子女，于出生14天內沒有HCMV感染，而于生后第3～12周內證實有HCMV感染，為嬰兒于出生過程或吸吮母乳感染。
③生后感染(postnatal infection)或獲得性感染(acquired infection)：由產(chǎn)后水平感染，主要是經(jīng)哺乳而感染和由患嬰造成的水平傳播感染。
在新生兒中以前2種方式為最重要。
(2)根據(jù)臨床征象分類：
①癥狀性感染(symptomatic infection)：出現(xiàn)HCMV感染相關的癥狀、體征，損害宿主兩個或兩個以上器官或系統(tǒng)時，稱全身性感染(systemic infection)，多見于先天性感染;主要集中于宿主的某一器官或系統(tǒng)，如肝臟或肺部時，則稱為CMV肝炎或CMV肺炎。
②亞臨床型感染(subclinical infection)：無任何臨床癥狀與體征，在新生兒中為非主要類型。

應與TORCH綜合征(風疹、單純皰疹和弓形蟲病等)中的其他疾病相鑒別。此外尚需與梅毒、李斯特菌或其他細菌性和感染性腦病，如敗血癥、傳染性單核細胞增多癥、淋巴結結核等鑒別。主要依靠病原學和免疫學檢查確診。
1.先天性弓形體感染 CMV表現(xiàn)及預后與先天性弓形體感染相似，主要依賴實驗室檢查鑒別診斷。
2.嬰兒肝炎 肝臟病理改變可見肝細胞水腫和類似慢性肝炎樣改變，又可引起重型肝炎改變。包涵體累及肝內膽管上皮細胞，引起膽管炎、膽汁淤積和黃疸。鑒別要點為CMV臨床表現(xiàn)為多系統(tǒng)、多臟器的損害和實驗室證實宿主體內有HCMV的侵入，即可診斷為CMV感染。
3.其他 與其他病因的病理性黃疸和其他感染性腦病、腦膜腦炎鑒別，主要依賴實驗室檢查結果鑒別。